Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FXNQ16595 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FXNQ16595 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms