Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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CCDC6Q16204 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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CCDC6Q16204 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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CCDC6Q16204 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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CCDC6Q16204 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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CCDC6Q16204 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
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CCDC6Q16204 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
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CCDC6Q16204 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CCDC6Q16204 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CCDC6Q16204 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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CCDC6Q16204 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CCDC6Q16204 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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