Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USF2Q15853 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USF2Q15853 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USF2Q15853 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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