Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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