Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms