Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRIP4Q15650 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms