Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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