Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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