Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NCAPHQ15003 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms