Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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