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| KLF9 | Q13886 | ADAM7-201 | ENST00000175238 | 3367 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.85 | □□□□□ -1.79 | | |
| KLF9 | Q13886 | SCEL-201 | ENST00000349847 | 2386 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 3.85 | □□□□□ -1.79 | | |
| KLF9 | Q13886 | LINC02458-201 | ENST00000500381 | 2941 nt | TSL 2 BASIC | 3.85 | □□□□□ -1.79 | | |
| KLF9 | Q13886 | NOL8P1-201 | ENST00000508336 | 3529 nt | BASIC | 3.85 | □□□□□ -1.79 | | |
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| KLF9 | Q13886 | AC068714.1-201 | ENST00000559623 | 800 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
| KLF9 | Q13886 | AC009117.1-201 | ENST00000563948 | 554 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
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| KLF9 | Q13886 | TPTEP1-208 | ENST00000636884 | 213 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
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| KLF9 | Q13886 | FAM197Y7-202 | ENST00000433321 | 2325 nt | TSL 2 BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
| KLF9 | Q13886 | CASP1-210 | ENST00000528974 | 1402 nt | TSL 2 BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.79 | | |
| KLF9 | Q13886 | AC007681.1-201 | ENST00000604271 | 3438 nt | TSL 4 BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | LINC01361-202 | ENST00000452834 | 1526 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | PATJ-202 | ENST00000316485 | 3657 nt | TSL 5 BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | AL442639.1-201 | ENST00000625030 | 1899 nt | BASIC | 3.84 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | THAP12P4-201 | ENST00000528321 | 2266 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | EPC1-203 | ENST00000375110 | 3909 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | CASC1-204 | ENST00000395990 | 2417 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | ARL15-202 | ENST00000504924 | 2486 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | ARL15-207 | ENST00000620747 | 2486 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | OTUD6B-AS1-201 | ENST00000522817 | 4275 nt | TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | ZEB1-205 | ENST00000446923 | 6267 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | CD80-201 | ENST00000264246 | 2725 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | PJA2-202 | ENST00000361557 | 4645 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | MEI4-201 | ENST00000602452 | 4800 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | OSBPL8-202 | ENST00000393249 | 7047 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | FAM169A-201 | ENST00000389156 | 5990 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | AGR3-201 | ENST00000310398 | 749 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | RPL7P26-201 | ENST00000333817 | 754 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | DEFB128-201 | ENST00000334391 | 373 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | Y_RNA.67-201 | ENST00000362870 | 100 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
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| KLF9 | Q13886 | MDM2-208 | ENST00000393410 | 732 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | RPL32P23-201 | ENST00000397237 | 405 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | C2orf73-203 | ENST00000405749 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |
| KLF9 | Q13886 | AL162578.1-201 | ENST00000406202 | 378 nt | BASIC | 3.83 | □□□□□ -1.8 | | |