Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SHROOM2Q13796 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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SHROOM2Q13796 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SHROOM2Q13796 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SHROOM2Q13796 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SHROOM2Q13796 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SHROOM2Q13796 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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SHROOM2Q13796 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHROOM2Q13796 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SHROOM2Q13796 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SHROOM2Q13796 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
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