Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.4
IRF5Q13568 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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IRF5Q13568 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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IRF5Q13568 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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IRF5Q13568 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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