Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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