Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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FOXE3Q13461 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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