Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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