Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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