Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRIM28Q13263 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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