Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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FOXD4Q12950 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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FOXD4Q12950 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
FOXD4Q12950 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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