Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms