Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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GTF3C1Q12789 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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