Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXO1Q12778 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXO1Q12778 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXO1Q12778 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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FOXO1Q12778 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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