Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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SOBPA7XYQ1 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SOBPA7XYQ1 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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