Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SPG7Q9UQ90 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SPG7Q9UQ90 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms