Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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USP18Q9UMW8 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USP18Q9UMW8 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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