Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
HOXD1Q9GZZ0 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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