Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
C15orf40Q8WUR7 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
C15orf40Q8WUR7 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
C15orf40Q8WUR7 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
C15orf40Q8WUR7 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
C15orf40Q8WUR7 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
C15orf40Q8WUR7 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms