Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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