Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
KNOP1Q1ED39 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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