Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TNXAQ16473 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TNXAQ16473 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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TNXAQ16473 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TNXAQ16473 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -2
TNXAQ16473 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TNXAQ16473 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
TNXAQ16473 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TNXAQ16473 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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