Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSX1Q16384 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms