Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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