Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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