Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZIC1Q15915 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZIC1Q15915 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZIC1Q15915 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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