Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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TTF1Q15361 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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TTF1Q15361 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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TTF1Q15361 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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TTF1Q15361 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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