Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
COL4A6Q14031 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL4A6Q14031 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
COL4A6Q14031 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL4A6Q14031 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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COL4A6Q14031 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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COL4A6Q14031 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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COL4A6Q14031 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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COL4A6Q14031 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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COL4A6Q14031 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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COL4A6Q14031 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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COL4A6Q14031 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL4A6Q14031 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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