Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CACNA1CQ13936 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms