Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL4AQ13619 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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CUL4AQ13619 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
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CUL4AQ13619 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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CUL4AQ13619 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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CUL4AQ13619 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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CUL4AQ13619 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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CUL4AQ13619 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL4AQ13619 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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