Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
FOXE3Q13461 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
FOXE3Q13461 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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