Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TCOF1Q13428 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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TCOF1Q13428 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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TCOF1Q13428 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TCOF1Q13428 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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