Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPRSQ13332 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPRSQ13332 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPRSQ13332 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPRSQ13332 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTPRSQ13332 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms