Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATMQ13315 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ATMQ13315 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ATMQ13315 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
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ATMQ13315 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ATMQ13315 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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ATMQ13315 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
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ATMQ13315 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ATMQ13315 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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