Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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