Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
FOXO1Q12778 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms