Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
E2F1Q01094 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms