Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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LINC00587B1AMM8 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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LINC00587B1AMM8 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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LINC00587B1AMM8 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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LINC00587B1AMM8 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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LINC00587B1AMM8 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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LINC00587B1AMM8 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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LINC00587B1AMM8 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
LINC00587B1AMM8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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