Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ap3m1Q9JKC8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ap3m1Q9JKC8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.8 ms