Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP3Q9H6T3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPAP3Q9H6T3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms