Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccer1Q9CQL2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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