Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNDC1Q96C34 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNDC1Q96C34 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms